Sporothrix ranii، گزارشی جدید از قارچ‌ همراه با درختان نخل در ایران

نوع مقاله : سیستماتیک و تنوع زیستی قارچ‌ها

نویسندگان

1 محقق پسادکتری گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران

2 استادیار پژوهش بخش گیاه‌پزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی صفی‌آباد، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، دزفول، ایران

3 استاد قارچ‌شناسی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران

10.22092/bot.j.iran.2023.362866.1366

چکیده

در زمستان 1401، طی پایش‌های متداول نخلستان‌های مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی صفی‌آباد دزفول (استان خوزستان)، پوشش سفید و متراکمی از کپک‌های قارچی روی تنه درختان به ویژه در انتهای برگ‌های بریده شده مشاهده گردید. جدایه‌های قارچی پس از جداسازی و خالص‌سازی تحت بررسی‌های ریخت‌شناسی و مولکولی قرار گرفتند. براساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی همچون کنیدیوم‌های تک‌سلولی، شفاف، صاف و بیضوی تا تخم‌مرغی توسعه یافته سیموپودیالی با زخم پایه‌ای برجسته تولید شده به صورت هولوبلاستیک روی سلول‌های کنیدیوم‌زای دندانه‌دار، مشخص شد که تمامی جدایه‌های قارچی به جنس Sporothrix تعلق دارند. همچنین، براساس تلفیقی از داده‌های ریخت‌شناسی و اطلاعات ناحیه ژنومی ITS-rDNA، مشخص شد که جدایه‌های قارچی به گونه‌ S. ranii تعلق دارند. لذا براساس اطلاعات موجود، این نخستین گزارش از این گونه برای قارچ‌های ایران و دومین گزارش آن در دنیا است.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


De Beer, Z.W. & Wingfield, M.J. 2013. Emerging lineages in the Ophiostomatales. In: Seifert, K.A., De Beer, Z.W. & Wingfield, M.J. (eds), The Ophiostomatoid Fungi: Expanding Frontiers. Centraalbureau voor Schimmelcultures (CBS), Utrecht, the Netherlands: CBS Biodiversity Series: 12: 21–46.
 de Beer, Z.W., Duong, T.A. & Wingfield, M.J. 2016. The divorce of Sporothrix and Ophiostoma: solution to a problematic relationship. Studies in Mycology 83: 165–191. https://doi. org/10.1016/j.simyco.2016.07.001.
de Meyer, E.M., De Beer, Z.W., Summerbell, R.C., Moharram, A.M., de Hoog, G.S., Vismer, H.F. & Wingfield, M.J. 2008. Taxonomy and phylogeny of new wood-and soil-inhabiting Sporothrix species in the Ophiostoma stenoceras-Sporothrix schenckii complex. Mycologia 100(4): 647–661. https://doi.org/10.3852/07-157R.
Edgar, R.C. 2004. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Research 32(5): 1792–1797. https://doi.org: 10.1093/nar/gkh340.
Hektoen, L. & Perkins, C.F. 1900. Refractory subcutaneous abscesses caused by Sporothrix schenckii. A new pathogenic fungus. The Journal of Experimental Medicine 5(1): 77–89.
Jankowiak, R., Bilański, P., Ostafińska, A. & Linnakoski, R. 2019. Ophiostomatales associated with wounds on hardwood trees in Poland. Plant Pathology 68(7): 1407–1424. https://doi.org/10.1111/ppa.13061.
Möller, E.M., Bahnweg, G., Sandermann, H. & Geiger, H.H. 1992. A simple and efficient protocol for isolation of high molecular weight DNA from filamentous fungi, fruit bodies, and infected plant tissues. Nucleic Acids Research 20(22): 6115–6116. https://doi.org/10.1093/nar/20.22.6115.
Moustafa, A.F. 1981. A new species of Sporothrix from Kuwait. Persoonia - Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi 11(3): 392–394.
Nylander, J.A.A. 2004. MrModeltest v. 2. Program Distributed by the Author. Uppsala: Evolutionary Biology Centre, Uppsala University.
Ostafińska, A., Jankowiak, R., Bilański, P., Solheim, H. & Wingfield, M.J. 2021. Six new species of Sporothrix from hardwood trees in Poland. MycoKeys 82: 1–32. https://doi.org/10.3897/mycokeys.82.66603.
Rambaut, A. 2009. FigTree v. 1.3.1. Available online at: http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree.
Rodrigues, A.M., Choappa, R.C., Fernandes, G.F., De Hoog, G.S. & De Camargo, Z.P. 2016. Sporothrix chilensis sp. nov. (Ascomycota: Ophiostomatales), a soil-borne agent of human sporotrichosis with mild-pathogenic potential to mammals. Fungal Biology 120(2): 246–264. https://doi.org/DOI: 10.1016/j.funbio.2015.05.006.
Ronquist, F. & Huelsenbeck, J.P. 2003. MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models. Bioinformatics 19(12): 1572–1574. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg180.
Schoch, C.L., Seifert, K.A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge, J.L., Levesque, C.A., Chen, W. & Fungal Barcoding Consortium, Fungal Barcoding Consortium Author List. 2012. Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi. Proceedings of the National Academy of Sciences 109(16): 6241–6246. https://doi.org/10.1073/pnas.1117018109.
Staden, R. 1996. The staden sequence analysis package. Molecular Biotechnology 5: 233. https://doi.org/10.1007/BF02900361.
Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. & Kumar, S. 2013. MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution 30(12): 2725–2729. https://doi.org/10.1093/molbev/mst197.
White, T.J., Bruns, T., Lee, S. & Taylor, J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. Pp. 315–322. In: A Guide to Methods and Applications PCR Protocols (Innis, M.A., Gelfand, D.H., Sninsky, J.J. & White, T.J. (eds). Academic Press. San Diego. California.
Zhou, X., Rodrigues, A.M., Feng, P. & De Hoog, G.S. 2014. Global ITS diversity in the Sporothrix schenckii complex.
Fungal Diversity 66(1): 153–165. https://doi.org/10.1007/s13225-013-0220-2.