گزارش‌ها و میزبان‏‌‌‌‌‌های جدید گونه‏‌‌‌‌‌‏‌‌‌‌‌های Curvularia در ایران

نوع مقاله : سیستماتیک و تنوع زیستی قارچ‌ها

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی‏‌‌‌‌‌ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‏‌‌‌‌‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران

2 دانشیار بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران؛ گروه بیوتکنولوژی، مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی و علوم زیستی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران

3 استاد بیماری‏‌‌‌‌‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‏‌‌‌‌‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز، ایران

چکیده

در مطالعه حاضر، هشت جدایه‏‌‌‌‌‌ از جنس Curvularia، جداسازی شده از گیاهان لوبیا چشم‌بلبلی، ذرت و شیشه‌شور در استان خوزستان، براساس روش‏‌‌‌‌‌ مبتنی بر فیلوژنی مولکولی و ریخت‏‌‌‌‌‌شناسی شناسایی شدند. زیست‏‌‌‌‌‌توده‌ میسلیومی جدایه‏‌‌‌‌‌ها، تولید شده در محیط مایع سیب زمینی-دکستروز، به وسیله‏‌‌‌‌‌ کاغذ صافی جمع‏‌‌‌‌‌آوری و خشک-‏‌‌‌‌‌انجمادی شد. توده‏‌‌‌‌‌ DNA با استفاده از یک روش مبتنی بر فنل و کلروفرم استخراج شد. بخش‏‌‌‌‌‌هایی از نواحی rDNA هسته‏‌‌‌‌‌ای و gpd با استفاده از آغازگر‏‌‌‌‌‌های مناسب تکثیر و سپس توالی‏‌‌‌‌‌یابی شدند. توالی‏‌‌‌‌‌های ITS و gpd مربوط به جدایه‏‌‌‌‌‌های تحت تحقیق با توالی‏‌‌‌‌‌های معتبر مربوط به سویه‏‌‌‌‌‌های تیپ در بانک ژن با استفاده از الگوریتم BLASTn و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی (مبتنی بر دو ناحیه‏‌‌‌‌‌ ژنومی) مورد مقایسه قرار گرفتند. بر این اساس، جدایه‏‌‌‌‌‌ها در سطح گونه شناسایی و گونه‏‌‌‌‌‌هایC. americana، C. muehlenbeckiae و C.verruculosa را شامل شدند. لذا، این نخستین گزارش دو گونه‏‌‌‌‌‌ C. americana و C. muehlenbeckiae در ایران می‏‌‌‌‌‌باشد. به علاوه، این مطالعه برای هر سه گونه‌‌‌‌‌ مورد بررسی میزبان جدیدی گزارش می‏‌‌‌‌‌کند و مشخصات ریخت‏‌‌‌شناسی و مولکولی بیشتری برای گونه‌ C.verruculosa ارایه می‏‌‌‌‌‌دهد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


Ahmadpour, A., Heidarian, Z., Karami, S., Pordel, A., Jabbarifar, S.M. & Javan-Nikkhah, M. 2013. New species of Bipolaris and Curvularia on poaceous plants in Iran. Rostaniha 14: 216–228.
Ahmadpour, S.A., Mehrabi-Koushki, M. & Farokhinejad, R. 2017. Neodidymelliopsis farokhinejadii, a new fungal species from dead branches of trees in Iran. Sydowia 69: 171–182.
Almaguer, M., Rojas, T.I., Dobal, V., Batista, A. & Aira. M.J. 2013. Effect of temperature on growthand germination of conidia in Curvularia and Bipolaris species isolated from the air. Aerobiologia29: 13–20.
Babaahmadi, G., Mehrabi-Koushki, M. & Hayati,J. 2018. Allophoma hayatii sp. nov., an undescribed pathogenic fungus causing dieback of Lantana camarain Iran. Mycological Progress 17(3): 365–379.
Beneke, E.S. & Rogers, A.L. 1996. Medical mycology and human mycoses. Star Publishing Company, Belmont, 239 pp.
Berbee, M., Pirseyedi, M. & Hubbard, S. 1999. Cochliobolus phylogenetics and the origin of known, highly virulent pathogens, inferred
from ITS and glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gene sequences. Mycologia 91: 964–977.
Boedijn, K.B. 1933. Ueber einige phragmosporen Dematiazeen. Bulletin du Jardin botanique de Buitenzorg 13: 120–134.
Dehdari, F., Mehrabi-Koushki, M. & Hayati, J. 2018. Curvularia shahidchamranensis sp. nov., a crude oil-tolerant fungus. Current Research in Environmental and Applied Mycology 8: 572–584.
Ershad, D. 2009. Fungi of Iran, 3rd edn. Iranian Research Institute ofPlant Protection, Tehran.
Gautam, A.K., Kant, M. & Thakur, Y. 2013. Isolation of endophytic fungi from Cannabis sativa and study their antifungal potential. Archive of Phytopathology and Plant Protection46: 627–635.
Hall, T.A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series 41: 95–98.
Hargreaves, M., Parappukkaran, S., Morawska, L., Hitchins, J., He, C. & Gilbert, D. 2003. A pilot investigation into associations between indoor airborne fungal and non-biological particle concentrations in residential houses in Brisbane, Australia. Science of Total Environment 312: 89–101.
Heidari, K., Farokhinejad, R. & Mehrabi-Koushki, M. 2018a. Occurrence of purslane leaf spot caused by Dichotomophthora lutea in Iran. Australasian Plant Disease Notes 13(1): 1–4.
Heidari, K., Mehrabi-Koushki M. & Farokhinejad R. 2018b. Curvularia mosaddeghii sp. nov., a novel species from the family Pleosporaceae. Mycosphere 9: 635–646.
Hibbett, D.S., Binder, M., Bischoff, J.F., Blackwell, M., Cannon, P.F., Eriksson, O.E., Huhndorf, S., James, T., Kirk, P.M., Stalpers, J.A., Crous, P.W., Gams, W. et al. 2007. A higher-level phylogenetic classification of the Fungi. Mycological Research 111: 509–547.
Jena, S.K. & Tayung, K. 2013. Endophytic fungal communities associated with two ethno-medicinal plants of Similipal Biosphere Reserve, India and their antimicrobial prospective. Journal of Applied Pharmaceutical Science 3: 7.
Liang, Y., Ran, S.F., Bhat, J., Hyde, K.D., Wang, Y. & Zhao, D.J. 2018. Curvularia microspora sp. nov. associated with leaf diseases of Hippeastrum striatum in China. MycoKeys 29: 49–61.
Madrid, H., da Cunha, K.C., Gene, J., Dijksterhuis, J., Cano, J., Sutton, D.A., Guarro, J. & Crous, P.W. 2014. Novel Curvularia species from clinical specimens. Persoonia 33: 48–60.
Manamgoda, D.S., Cai, L., Bahkali, A.H., Chukeatirote, E. & Hyde, K.D. 2011. Cochliobolus: an overview and current status of species. Fungal Diversity 51: 3–42.
Manamgoda, D.S., Cai, L., McKenzie, E.H., Crous, P.W., Madrid, H., Chukeatirote, E., Shivas, R.G., Tan, Y.P. & Hyde, K.D. 2012. A phylogenetic and taxonomic re-evaluation
of the Bipolaris-Cochliobolus-Curvularia complex. Fungal Diversity 56: 131–44.
Manamgoda, D.S., Cai, L., McKenzie, E.H.C., Chukeatirote, E. & Hyde, K.D. 2012. Two new Curvularia species from northern Thailand. Sydowia 64: 255–266.
Manamgoda, D.S., Rossman, A.Y., Castlebury, L.A., Chukeatirote, E. & Hyde, K.D. 2015. taxonomic and phylogenetic re-appraisal of the genus Curvularia (Pleosporaceae): human and plant pathogens. Phytotaxa 212: 175–198.
Manamgoda, D.S., Rossman, A.Y., Castlebury, L.A., Crous, P.W., Madrid, H., Chukeatirote, E. & Hyde, K.D. 2014. The genus Bipolaris. Studies in Mycology 79: 221–288.
Marin-Felix, Y., Groenewald, J.Z., Cai, L., Chen, Q., Marincowitz, S., Barnes, I., Bensch, K., Braun, U., Camporesi, E., Damm, U., de Beer, Z.W., Dissanayake, A., Edwards, J., Giraldo, A., Hernández-Restrepo, M., Hyde, K.D., Jayawardena, R.S., Lombard, L., Luangsa-ard, J., McTaggart, A.R., Rossman, A.Y., Sandoval-Denis, M., Shen, M., Shivas, R.G., Tan, Y.P., van der Linde, E.J., Wingfield, M.G.,  Wood, A.R., Zhang, J.Q., Zhang Y. & Crous, P.W. 2017a. Genera of phytopathogenic fungi: GOPHY 1. Studies in Mycology 86: 99–216.
Marin-Felix, Y., Senwanna, C., Cheewangkoon, R. & Crous, P.W. 2017b. New species and records of Bipolaris and Curvularia from Thailand. Mycosphere 8: 1556–1574.
Mehrabi-Koushki, M., Pooladi, P., Eisvand, P. & Babaahmadi, G. 2018. Curvularia ahvazensis and C. rouhanii spp. nov. from Iran. Mycosphere 9: 1173–1186.
O’Donnell, K. 1993. Fusarium and ITS near relatives, pp. 225–233. In: Reynolds, D.R. & Taylor, J.W. (eds). The fungal holomorph: mitotic, meiotic and pleomorphic speciation in fungal systematics. CABI Publishing, Wallingford.
Raeder, U. & Broda, P. 1985. Rapid preparation of DNA from filamentous fungi. Letters in Applied Microbiology 1: 17–20.
Scott, E.M. & Carter, R.T. 2014. Canine keratomycosis in 11 dogs: A case series (2000–2011). Journal of the American Animal Hospital Association 50: 112–118.
Sharma, R., Prakash, O., Sonawane, M.S., Nimonkar, Y., Golellu, P.B. & Sharma, R. 2016. Diversity and distribution of phenol oxidase producing fungi from soda lake and description of Curvularia lonarensis sp. nov. Frontiers in Microbiology 7: 1847.
Tadych, M., Bergen, M., Johnson, J.C., Polashock, J. & Vorsa, N. 2012. Endophytic and pathogenic fungi of developing cranberry ovaries from flower to mature fruit: diversity and succession. Fungal Diversity 54: 101–116.
Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. & Kumar, S. 2013. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution 30: 2725–2729.
Tan, Y.P., Madrid, H., Crous, P.W. & Shivas, R.G. 2014. Johnalcornia gen. et. comb. nov., and nine new combinations in Curvularia based on molecular phylogenetic analysis. Australasian Plant Pathology 43: 589–603.
Tan, Y.P., Crous, P.W. & Shivas R.G. 2018. Cryptic species of Curvularia in the culture collection of the Queensland Plant Pathology Herbarium. MycoKeys 35: 1–25.
Tomaso-Peterson, M., Jo, Y.K., Vines, P.L. & Hoffmann, F.G. 2016. Curvularia malina sp. nov. incites a new disease of warm-season turf grasses in the southeastern United States. Mycologia 108: 915–924.
Verma, P., Singh, S. & Singh, R. 2013. Seven species of Curvularia isolated from three lakes of Bhopal. Advances in Life Science and Technology 8: 13–15.
White, T.J., Bruns, T., Lee, S. & Taylor, J.L. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics, pp. 315–322. In: Innis, M.A., Gelfand, D.H., Sninsky, J.J. & White, T.J. (eds). PCR protocols: a guide to methods and applications. Academic Press.