فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان

شریفی, کسری; زارع, رسول; زمانی‌زاده, حمیدرضا; میرابوالفتحی, منصوره; رضائی, سعید

doi:10.22092/botany.2017.113230

فیلوژنی و تنوع ژنتیکی گونه ‌مرکب Fusarium graminearum مرتبط با سوختگی فوزاریومی خوشه گندم در دشت مغان

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

¹ گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران

² استاد پژوهش، بخش تحقیقات رستنی‌ها، مؤسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

³ استاد گروه بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران (hzamani@srbiau.ac.ir)

⁴ استاد پژوهش، بخش تحقیقات بیماری‌های گیاهان، مؤسسه تحقیقات گیاه‌پزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

⁵ استادیار گروه بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران

10.22092/botany.2017.113230

چکیده

خصوصیات فیلوژنتیکی 37 جدایه متعلق به گونه مرکب F. graminearum، جدا شده از خوشه گندم با علایم بیماری سوختگی فوزاریومی از مناطق مختلف کشت گندم در دشت مغان، استان‌ اردبیل تعیین شد. بخشی از ژن‌های translation elongation factor 1-alpha (TEF)،reductase (RED) و UTP-ammonia ligase (URA) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر، تعیین توالی و با الگوریتم تحلیل امساکی تجزیه شد. همه سویه‌های گونه مرکب F. graminearum متعلق به F. graminearum sensu stricto بودند. نتایج فیلوژنی نشان‌دهنده وجود همگنی ژنتیکی در بین جدایه‌های گونه‌ مرکب F. graminearum بود. به منظور ارزیابی ساختار ژنتیکی جمعیت قارچ F. graminearum s.s. از نشانگر ISSR استفاده شد. پنج آغازگر واجد چندشکلی زیاد و تکرارپذیری بالا برای تکثیر DNA جدایه‌ها استفاده شد. تجزیه خوشه‌ای داده‌ها، با استفاده از روش UPGMA و ضریب تشابه جاکارد انجام و ژنوتیپ‌ها را در سطح تشابه 82% به چهار گروه مجزا تفکیک کرد. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان‌دهنده، بیشترین تنوع ژنتیکی در داخل جمعیت F. graminearum s.s. (%97) و کمترین در بین جمعیت‌ها (3%) بود. شناسایی فیلوژنتیکی و آگاهی از تنوع ژنتیکی عامل اصلی بیماری FHB‏، در تعیین روند تکامل بیمارگر و استراتژی‌های مدیریت بیماری مفید خواهد بود.

کلیدواژه‌ها