آغازگرهای اختصاصی مبتنی بر واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای ردیابی Picoa lefebvrei در ریشه‌های Carex stenophylla

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسنده

استادیار قارچ‌شناسی بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران (jamali454@yahoo.com)

چکیده

گونه‌های Picoa، آرایه‌های آسکومیست زیرزمینی می‌باشند که در نواحی نیمه‌خشک شمال آفریقا، غرب آسیا، جنوب اروپا و کشورهای خاورمیانه از جمله ایران یافت می‌شود. گونه‌های این جنس با ریشه گیاهان علفی یک‌ساله و چند‌ساله از جنس Helianthemum شامل:H. ledifolium،H. salicifolium var. salicifolium ، H. nummularium و H. squamatum تشکیل قارچ-ریشه می‌دهند. در ایران، رابطه قارچ-ریشه بین دنبل‌های بیابانی و گیاهان تیره جگنیان به طور کامل بررسی نشده است. در این مطالعه، ریشه‌های Wahlenb Carex stenophylla از مراتع مختلف جمع‌آوری شد که بررسی‌های مزرعه‌ای و آناتومیکی رابطه قارچ-ریشه خارجی این گونه گیاهی با دنبل بیابانی P. lefebvrei را مشخص کرد. میسلیوم‌های خارجی در اطراف تمام ریشه‌های تشکیل دهنده قارچ-ریشه مشاهده شدند. نواحی یگانه توالی‌های جداکننده نسخه‌برداری شده داخلی 1، 2 و ژن 8/5 اس دی.­ان.­ای. ریبوزومی گونه قارچی در ریشه گیاهان با روش واکنش زنجیره‌ای پلیمراز تو در تو و استفاده از آغازگرهای عمومی ITS1/ITS4 و آغازگرهای اختصاصی طراحی شدهFLE 5´GTA CCT TAC CTG TTG CTT CCG TG ,) (RLE 5´ATC CCT ACC TGA GCC GAG GTC AA تکثیر شد. با استفاده از این روش، محصولی به اندازه 500 جفت باز از ریشه گیاهان همزیست به دست آمد که با نمونه‌های P. lefebvrei ثبت شده در بانک ژن صد در صد شباهت داشتند. این موضوع ثابت کرد که محصول واکنش زنجیره‌ای پلیمراز تکثیر شده با آغازگرهای اختصاصی، متعلق به گونه P. lefebvrei بوده و به این ترتیب ارتباط میکوریزی این گونه قارچی با گونه گیاهی C. stenophylla به اثبات رسید.

کلیدواژه‌ها


منابع در متن می‌باشد.