فیلوژنی مولکولی سه گونه دنبلان کوهی از ایران براساس ژنوم ریبوزومی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 استادیار بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، باجگاه، شیراز، کد پستی 7144133111. (E-mail: rmostofi@shirazu.ac.ir)

2 دانشجوی دکتری بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، باجگاه، شیراز، کد پستی 7144133111.

3 استاد بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، باجگاه، شیراز، کد پستی 7144133111.

چکیده

نمونه‌هایی از سه گونه دنبلان کوهی از مناطق مختلف جغرافیایی ایران جمع‌آوری شد. منطقه ITS شامل ژنS 8/5 از rDNA با استفاده از آغازگرهای عمومی ITS4 وITS1  تکثیر و توالی‌یابی شد. توالی‌های به دست آمده با سایر آرایه‌های معتبرِ مستخرج از بانک ژن مقایسه شد. در میان 12 نمونه مطالعه شده، هفت جدایه با نمونه‌های Terfezia claveryi گزارش شده توسط سایر محققان، مطابقت داشت. نمونه‌های T. claveryi ایرانی به طور میانگین 4/99% (با دامنه 7/98-100%) با یکدیگر تشابه داشتند، در حالی که میانگین تشابه کلیه T. claveryi های مورد مطالعه2/95% (با دامنه 2/87-100%) بود. چهار نمونه مطابق با Trimania pinoyi، به صورت آرایه خواهری Tirmania nivea خود را نشان دادند که از گونه اخیر تنها یک نمونه یافت شد. نمونه‌های T. pinoyi ایران دارای 9/99% میانگین تشابه (با دامنه 8/99-100%) در بین خود و 2/97% (با دامنه 1/93-100%) میانگین تشابه در بین کلیه توالی‌های مورد مقایسه بودند. 

کلیدواژه‌ها

فایل ها

سابقه مقاله

  • تاریخ دریافت: 08 اردیبهشت 1389
  • تاریخ بازنگری: 08 تیر 1389
  • تاریخ پذیرش: 01 آبان 1389

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار