Neodeightonia phoenicum, a new species for the funga of Iran

Document Type : Research Paper

Authors

1 Assistant Prof., Department of Biodiversity, Institute of Science and High Technology and Environmental Sciences, Graduate University of Advanced Technology, Kerman, Iran (a.habibi@kgut.ac.ir)

2 Associate Prof., Department of Plant Protection, College of Agriculture, Yasouj University, Iran

10.22092/bot.j.iran.2024.364735.1380

Abstract

Coconut fruits showing rot symptoms were collected throughout Kerman Province (Iran) markets. The aim of this study was to identify the causal agent of the observed symptom. To isolate the pathogen, tissue pieces were taken from the interface of the symptomatic and healthy areas of the inner parts of the fruits and placed on potato dextrose agar (PDA) medium. A filamentous fungus was consistently isolated from the symptomatic tissues. Colonies on PDA were white with fluffy aerial mycelium gradually turning olivaceous in the center. Conidiomata formed on pine needles, pycnidial and dark brown to black Conidiogenous cells were hyaline, cylindrical, smooth and swollen at base. Immature conidia were single-celled, ovoid to ellipsoid and hyaline and mature conidia were septate, dark brown, measuring 21.1 ± 1.2 × 10.5 ± 0.8 μm. Based on morphological characterization coupled with molecular data of ITS and tef1, the fungus was identified as Neodeightonia phoenicum. This is the first report of N. phoenicum on Cocos nucifera worldwide and the first report of its occurrence in Iran.

Keywords

Main Subjects


Article Title [Persian]

Neodeightonia phoenicum، گونه جدیدی برای قارچ‌های ایران

Authors [Persian]

  • آزاده حبیبی 1
  • فریبا قادری 2
1 استادیار گروه تنوع زیستی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان، ایران
2 دانشیار گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران
Abstract [Persian]

 طی نمونه‌برداری‌های انجام شده از نارگیل‌های موجود در بازار در سطح استان کرمان نمونه‌های دارای پوسیدگی جمع‌آوری شد. این پژوهش به منظور شناسایی عوامل ایجاد کننده علایم انجام شد. برای جداسازی قارچ عامل بیماری، قطعات بافت از محل بین ناحیه دارای علایم و سالم از میوه نارگیل برداشته و روی محیط کشت PDA کشت داده شد. جدایه‌های قارچی به دست آمده، روی محیط کشت PDA، پرگنه‌های سفید با مرکز زیتونی رنگ تولید کرد. یاخته‌های کنیدیوم‌زا شفاف، سیلندری شکل با دیواره صاف و تورم اندکی در پایه بودند. کنیدیوم‌های نابالغ تک‌یاخته‌ای، تخم‌مرغی تا بیضوی و شفاف و کنیدیوم‌های بالغ دویاخته‌ای، قهوه‌ای تیره و با ابعاد 1/21 ± 2/1 × 5/10 ± 8/0 میکرومتر بودند. با استفاده از تلفیق داده‌های ریخت‌شناختی و داده‌های مولکولی نواحی ITS و tef1 تحت عنوان گونه Neodeightonia phoenicum A.J.L. Phillips & Crous شناسایی شد. براساس اطلاعات موجود، این نخستین گزارش از این گونه برای قارچ‌های ایران و نخستین گزارش آن روی میزبان Cocos nucifera L. (Arecaceae) در جهان است. 

Keywords [Persian]

  • پوسیدگی میوه
  • کرمان
  • محصول گرمسیری
  • نخل
  • Cocos nucifera
  • Botryosphaeriaceae
Carbone, I. & Kohn, L.M. 1999. A method for designing primer sets for speciation studies in filamentous ascomycetes. Mycologia 91(3): 553–556. DOI: 10.1080/00275514.1999.12061051.
Crous, P.W., Slippers, B., Wingfield, M.J., Rheeder, J., Marasas, W.F., Philips, A.J., Alves, A., Burgess, T., Barber, P. & Groenewald, J.Z. 2006. Phylogenetic lineages in the Botryosphaeriaceae. Studies in Mycology 55(1): 235–253. DOI: 10.3114/sim0020.
da Silva Fonseca, M., Marchioro, M.L., Guimarães, D.K., Góes-Neto, A., Drechsler-Santos, E.R., Santos, V.A., Barbosa-Dekker, A.M., Dekker, R.F. & Cunha, M.A. 2020. Neodeightonia phoenicum CMIB-151: isolation, molecular identification, and production and characterization of an exopolysaccharide. Journal of Polymer Environment 28: 1954–1966. DOI: 10.1007/s10924-020-01744-5.
Dheepa, R., Goplakrishnan, C., Kamalakannan, A., Nakkeeran, S., Mahalingam, C.A. & Suresh, J. 2018. Coconut nut rot disease in India: Prevalence, characterization of pathogen and standardization of inoculation techniques. International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences 7(2): 2046–2057. DOI: 10.20546/ijcmas.2018.702.245.
Dai, D.Q., Phookamsak, R., Wijayawardene, NN., Li, W.J., Bhat, D.J., Xu, J.C., Taylor, J.E., Hyde, K.D. & Chukeatirote, E. 2017. Bambusicolous fungi. Fungal Diversity 82: 1–105. DOI: 10.1007/s13225-016-0367-8.
FAO, 2021. FAOStat. Vol. 2014. Rome: Food and Agriculture Organization of the United Nations.
Goudarzi, A., Askari Seyahooei, M. & Bagheri, A. 2019. Coconut malformation: An emerging disease caused by Fusarium proliferatum in southern Iran. Journal of Phyto-pathology 167(11–12): 609–617. DOI: 10.1111/jph.12851.
Ligoxigakis, E.K., Markakis, E.A., Papaioannou, I.A. & Typas, M.A. 2013. First report of palm rot of phoenix spp. caused by Neodeightonia phoenicum in Greece. Plant Disease 97(2): 286. DOI: 10.1094/PDIS-08-12-0727-PDN.
Liu, J., Chomnunti, P., Cai, L., Phookamsak, R., Chukeatirote, E., Jones, E.B., Moslem, M. & Hyde, K.D. 2010. Phylogeny and morphology of Neodeightonia palmicola sp. nov. from palms. Sydowia 62(2): 261–276.
Nishad, R. & Ahmed, T.A. 2020. Survey and Identification of Date Palm Pathogens and Indigenous Biocontrol Agents. Plant Disease 104(9): 2498–2508. DOI: 10.1094/PDIS-12-19-2556-RE.
Phillips, A.J., Alves, A., Pennycook, S.R., Johnston, P.R., Ramaley, A., Akulov, A. & Crous, P.W. 2008. Resolving the phylogenetic and taxonomic status of dark-spored teleomorph genera in the Botryosphaeriaceae. Persoonia: Molecular Phylogeny Evolution of Fungi 21(1): 29–55. DOI: 10.3767/003158508X340742.
Punithalingam, E. 1969. Studies on Sphaeropsidales in culture. Mycological Papers 119: 1–24.
Swofford, D.L. 2002. PAUP*: phylogenetic analysis using parsimony (*and other methods). Sinauer Associates, Sunderland.
Taylor, J.E. & Hyde, K.D. (eds). 2003. Microfungi of tropical and temperate palms. Fungal Diversity Research Series 12, Fungal Diversity Press.
von Arx, J.A. & Müller, E. 1975. A re-evaluation of the bitunicate ascomycetes with keys to families and genera. Studies in Mycology 9. Centraalbureau voor Schimmelcultures.
White, T.J., Bruns, T., Lee, S.J. & Taylor, J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. Pp. 315–322. In: Innis, M.A., Gelfand, D.H., Sninsky, J.J. & White, T.J. (eds), PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. Academic Press Inc., New York, USA.
Xiong, Y., Manawasinghe, I.S., Liao, C., Hyde, K.D. & Dong, Z 2022. Neodeightonia arengae sp. nov., Botryosphaeriaceous taxa on Arenga tremula (Arecaceae) from Guangdong, China. Phytotaxa 530(2): 130–140. DOI: 10.11646/phytotaxa.530.2.1.
Zhang, W. & Song, X. 2022. Occurrence of leaf spot caused by Neodeightonia phoenicum on Pygmy date palm (Phoenix roebelenii) in China. Plant Disease 106(8): 2269. DOI: 10.1094/PDIS-10-21-2190-PDN.