Sporothrix ranii, a new wood-inhabiting fungus associated with date palm trees in Iran

Document Type : Systematics and Biodiversity of Fungi

Authors

1 Postdoc Researcher, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, P.O. Box 51666-14766, Tabriz, Iran

2 Research Assistant Prof., Department of Plant Protection, Safiabad Agricultural Research and Education and Natural Resources Center, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Dezful, Iran, P.O. Box 64631-64009

3 Prof. in Mycology, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, P.O. Box 51666-14766, Tabriz, Iran

10.22092/bot.j.iran.2023.362866.1366

Abstract

In the winter of 2023 and during routine examinations of date palm trees in Safiabad, Dezful (Khuzestan Province, Iran), an intense white mass of fungal molds was observed on the leaf scars of the said trees. Purified isolates were subjected to morphological and molecular examinations. Typical morphological characteristics viz. single-celled, hyaline, smooth and obovate to ellipsoidal conidia arising by sympodial growth with basal scar prominent produced holoblastically on denticulate conidiogenous cells revealed that, all fungal isolates belong to the genus Sporothrix. Furthermore, based on a combination of morphological and sequence data of internal transcribed spacer (ITS) of rDNA, the recovered fungal isolates were determined as S. ranii. Therefore, based on the present information, it is the first report of this species for the funga of Iran and its second report in the world.

Keywords

Main Subjects

Article Title [Persian]

Sporothrix ranii، گزارشی جدید از قارچ‌ همراه با درختان نخل در ایران

Authors [Persian]

  • ابوالفضل نرمانی 1
  • کیوان کریمی 2
  • مهدی ارزنلو 3
1 محقق پسادکتری گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
2 استادیار پژوهش بخش گیاه‌پزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی صفی‌آباد، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، دزفول، ایران
3 استاد قارچ‌شناسی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
Abstract [Persian]

در زمستان 1401، طی پایش‌های متداول نخلستان‌های مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی صفی‌آباد دزفول (استان خوزستان)، پوشش سفید و متراکمی از کپک‌های قارچی روی تنه درختان به ویژه در انتهای برگ‌های بریده شده مشاهده گردید. جدایه‌های قارچی پس از جداسازی و خالص‌سازی تحت بررسی‌های ریخت‌شناسی و مولکولی قرار گرفتند. براساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی همچون کنیدیوم‌های تک‌سلولی، شفاف، صاف و بیضوی تا تخم‌مرغی توسعه یافته سیموپودیالی با زخم پایه‌ای برجسته تولید شده به صورت هولوبلاستیک روی سلول‌های کنیدیوم‌زای دندانه‌دار، مشخص شد که تمامی جدایه‌های قارچی به جنس Sporothrix تعلق دارند. همچنین، براساس تلفیقی از داده‌های ریخت‌شناسی و اطلاعات ناحیه ژنومی ITS-rDNA، مشخص شد که جدایه‌های قارچی به گونه‌ S. ranii تعلق دارند. لذا براساس اطلاعات موجود، این نخستین گزارش از این گونه برای قارچ‌های ایران و دومین گزارش آن در دنیا است.

Keywords [Persian]

  • اپی‌فیت
  • ریخت‌شناسی
  • کپک قارچی
  • ناحیه فاصله‌انداز داخلی-دی‌ان‌ای ریبوزومی
  • Phoenix dactylifera

References

De Beer, Z.W. & Wingfield, M.J. 2013. Emerging lineages in the Ophiostomatales. In: Seifert, K.A., De Beer, Z.W. & Wingfield, M.J. (eds), The Ophiostomatoid Fungi: Expanding Frontiers. Centraalbureau voor Schimmelcultures (CBS), Utrecht, the Netherlands: CBS Biodiversity Series: 12: 21–46.
 de Beer, Z.W., Duong, T.A. & Wingfield, M.J. 2016. The divorce of Sporothrix and Ophiostoma: solution to a problematic relationship. Studies in Mycology 83: 165–191. https://doi. org/10.1016/j.simyco.2016.07.001.
de Meyer, E.M., De Beer, Z.W., Summerbell, R.C., Moharram, A.M., de Hoog, G.S., Vismer, H.F. & Wingfield, M.J. 2008. Taxonomy and phylogeny of new wood-and soil-inhabiting Sporothrix species in the Ophiostoma stenoceras-Sporothrix schenckii complex. Mycologia 100(4): 647–661. https://doi.org/10.3852/07-157R.
Edgar, R.C. 2004. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Research 32(5): 1792–1797. https://doi.org: 10.1093/nar/gkh340.
Hektoen, L. & Perkins, C.F. 1900. Refractory subcutaneous abscesses caused by Sporothrix schenckii. A new pathogenic fungus. The Journal of Experimental Medicine 5(1): 77–89.
Jankowiak, R., Bilański, P., Ostafińska, A. & Linnakoski, R. 2019. Ophiostomatales associated with wounds on hardwood trees in Poland. Plant Pathology 68(7): 1407–1424. https://doi.org/10.1111/ppa.13061.
Möller, E.M., Bahnweg, G., Sandermann, H. & Geiger, H.H. 1992. A simple and efficient protocol for isolation of high molecular weight DNA from filamentous fungi, fruit bodies, and infected plant tissues. Nucleic Acids Research 20(22): 6115–6116. https://doi.org/10.1093/nar/20.22.6115.
Moustafa, A.F. 1981. A new species of Sporothrix from Kuwait. Persoonia - Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi 11(3): 392–394.
Nylander, J.A.A. 2004. MrModeltest v. 2. Program Distributed by the Author. Uppsala: Evolutionary Biology Centre, Uppsala University.
Ostafińska, A., Jankowiak, R., Bilański, P., Solheim, H. & Wingfield, M.J. 2021. Six new species of Sporothrix from hardwood trees in Poland. MycoKeys 82: 1–32. https://doi.org/10.3897/mycokeys.82.66603.
Rambaut, A. 2009. FigTree v. 1.3.1. Available online at: http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree.
Rodrigues, A.M., Choappa, R.C., Fernandes, G.F., De Hoog, G.S. & De Camargo, Z.P. 2016. Sporothrix chilensis sp. nov. (Ascomycota: Ophiostomatales), a soil-borne agent of human sporotrichosis with mild-pathogenic potential to mammals. Fungal Biology 120(2): 246–264. https://doi.org/DOI: 10.1016/j.funbio.2015.05.006.
Ronquist, F. & Huelsenbeck, J.P. 2003. MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models. Bioinformatics 19(12): 1572–1574. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg180.
Schoch, C.L., Seifert, K.A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge, J.L., Levesque, C.A., Chen, W. & Fungal Barcoding Consortium, Fungal Barcoding Consortium Author List. 2012. Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi. Proceedings of the National Academy of Sciences 109(16): 6241–6246. https://doi.org/10.1073/pnas.1117018109.
Staden, R. 1996. The staden sequence analysis package. Molecular Biotechnology 5: 233. https://doi.org/10.1007/BF02900361.
Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. & Kumar, S. 2013. MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution 30(12): 2725–2729. https://doi.org/10.1093/molbev/mst197.
White, T.J., Bruns, T., Lee, S. & Taylor, J. 1990. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. Pp. 315–322. In: A Guide to Methods and Applications PCR Protocols (Innis, M.A., Gelfand, D.H., Sninsky, J.J. & White, T.J. (eds). Academic Press. San Diego. California.
Zhou, X., Rodrigues, A.M., Feng, P. & De Hoog, G.S. 2014. Global ITS diversity in the Sporothrix schenckii complex.
Fungal Diversity 66(1): 153–165. https://doi.org/10.1007/s13225-013-0220-2.
Rostaniha
Volume 24, Issue 2 - Serial Number 69
December 2023
Pages 187-192

Files

History

  • Receive Date: 12 July 2023
  • Revise Date: 05 August 2023
  • Accept Date: 06 August 2023
  • Publish Date: 13 December 2023

Share

How to cite

Statistics