Morphological and molecular study on some species of Phoma and related taxa in Iran

Document Type : Research Paper

Authors

1 PhD Student of Plant Pathology, Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science and Engineering, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran

2 Associate Prof. of Mycology, Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science and Engineering, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj 31587-77871, Iran (fotowhi@ut.ac.ir)

3 Prof. of Mycology, Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science and Engineering, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran

Abstract

The genus Phoma Sacc. consists of important fungal plant pathogenic species occurring on economically important cultivated crops in spite of many other saprobic species. Thus, the aim of this study was to identify 35 isolates of Phoma species and related taxa collected from different hosts by means of morphological and molecular characters. Multi-locus phylogenetic analyses based on ITS1-5.8S-ITS2, actin and β-tubulin gene regions were conducted. Therefore, seven species including Boeremia exigua, Didymella acetosellae, D. bellidis, D. pinodella, Neocamarosporium betae, Phoma destructiva var. destructive, and P. medicaginis were identified and described, and among them, three species including D. bellidis, D. acetosellae, and P. destructiva var. destructiva are new records for the mycobiota of Iran. Also, B. exigua,and D. pinodella are reported for the first time from new host plants including Paliurus spina-christi, and Trigonella-foenum graecum, respectively. The morphological features and phylogenetic analyses were able to clarify the generic and species delimitation very clearly.

Keywords


Article Title [Persian]

مطالعه ریخت‌شناختی و مولکولی برخی گونه‌های جنس Phoma و آرایه‌های وابسته در ایران

Authors [Persian]

  • الهام امیردهی 1
  • خلیل بردی فتوحی فر 2
  • محمد ‌جوان نیکخواه 3
1 دانشجوی دکتری گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
2 دانشیار گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران 77871-31587 (fotowhi@ut.ac.ir)
3 استاد گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
Abstract [Persian]

جنس Phoma علاوه بر گونه­های ساپروفیت، گونه­های بیمارگر فراوانی نیز دارد که سبب خسارت در محصولات زراعی مهم اقتصادی می‌­شوند. بنابراین، هدف از این تحقیق شناسایی ریخت‌شناختی و مولکولی 35 جدایه از گونه­های متعلق به جنس Phoma و آرایه­های وابسته و جمع‌آوری شده از میزبان­های مختلف بود. مطالعه فیلوژنتیکی چندژنی براساس توالی­یابی نوکلئوتیدی سه ناحیه ژنومی ITS1-5.8S-ITS2، اکتین و بتا توبولین انجام شد. در نتیجه، هفت گونه به اسامی Boeremia exigua،Didymella acetosellae ،D. bellidis، D. pinodella ،Neocamarosporium betae ،Phoma destructiva var. destructiva  و P. medicaginis شناسایی و توصیف شدند که از این میان، سه گونه D. bellidis، D. acetosellae وvar. destructiva  P. destructiva برای نخستین بار برای میکوبیوتای ایران و دو گونه B. exigua و D. pinodella نیز به ترتیب از میزبان­های گیاهی جدید Paliurus spina-christi و Trigonella-foenum graecum گزارش می­شوند. ویژگی­های ریخت­شناختی و تجزیه و تحلیل­های فیلوژنتیکی به خوبی قادر بود حدود و ثغور جنس­ها و گونه­ها را تعیین نماید.

Keywords [Persian]

  • آرایه
  • اکتین و بتا توبولین
  • فیلوژنی
  • ITS1-5.8S-ITS2
  • Phoma
منابع در متن می‌باشد.