Phylogeny of Phytophthora and Phytopythium species associated with rice in Fars province (Iran)

Document Type: Research Paper

Authors

1 MSc Graduate, Department of Plant Protection, School of Agriculture, Shiraz University, Shiraz 7144165186, Iran

2 Prof., Department of Plant Protection, School of Agriculture, Shiraz University, Shiraz 7144165186, Iran (rmostofi@shirazu.ac.ir)

Abstract

In order to investigate the Oomyceteous species of the rice paddy fields of Fars province (Iran), during 2013–15, infected roots and crowns together with soil around seedlings and irrigation water were sampled. Based on the morphological, morphometric and physiological studies along with phylogenetic analyses of internal transcribed spacer sequences based on neighbor joining method, two Phytophthora species from Clades 6 and 8, including P. inundata,and P. pseudocryptogea and three Phytopythium species from a distinct clade, including Phpy. litorale, Phpy. ostracodes, and Phpy. sterile were identified. Phytopythium litorale,and Phpy. sterile were distinguished through morphological studies along with phylogenetic analysis. Phytopythium sterile was also new to the Oomyceteous mycobiota of Iran. All species were reported for the first time in the world from rice rhizosphere.

Keywords


Article Title [Persian]

فیلوژنی گونه‌های Phytophthora و Phytopythium در شالیزارهای برنج در استان فارس

Authors [Persian]

  • فاطمه سلمانی‌نژاد 1
  • رضا مستوفی زاده قلمفرسا 2
1 دانش‌آموخته کارشناسی ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز، شیراز 7144165186، ایران
2 استاد بیماری‌شناسی گیاهی، بخش گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز، شیراز 7144165186، ایران (rmostofi@shirazu.ac.ir)
Abstract [Persian]

به منظور بررسی گونه‌های اُاُمیست شالیزارهای برنج استان فارس طی سال‌های 94-1392 از خاک، آب آبیاری، ریشه و طوقه گیاهان بیمار نمونه‌برداری انجام گرفت. براساس مطالعات ریخت‌شناختی، ریخت‌سنجی، فیزیولوژیکی جدایه‌ها و همچنین بررسی‌های فیلوژنتیکی فاصله ترانویسی شده داخلی (آی‌تی‌اِس) دی‌اِن‌اِی ریبوزومی با روش پیوست همسایه‌ها، دو گونه Phytophthora از تبارهای 6 و 8 درخت آی‌تی‌اِس شامل P. inundata و P. pseudocryptogea و سه گونه Phytopythium در یک تبار مجزا شاملPhpy. litorale، Phpy. ostracodes و Phpy. sterile شناسایی شد. تفکیک دو گونه Phpy. litorale و Phpy. sterile از طریق مطالعات ریخت‌شناختی به همراه واکاوی‌های فیلوژنتیکی صورت گرفت. گونه Phpy. sterile برای فلور اُاُمیستی ایران جدید است. همچنین، تمامی گونه‌ها برای نخستین بار در دنیا از فراریشه برنج گزارش می‌شوند.

Keywords [Persian]

  • اُاُمیکوتا
  • تبار
  • ریخت‌شناختی
  • فیلوژنی
  • Pythiaceae
منابع در متن می‌باشد.