Molecular and morphological taxonomy of Pythium species isolated from soil in West Azarbaijan province (N.W. Iran)

Document Type : Research Paper

Authors

1 Graduated MSc Student, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Urmia University, P.O. Box 165, Urmia, Iran

2 Assistant Prof., Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Urmia University, P.O. Box 165, Urmia, Iran

3 Associate Prof., Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Kurdistan, P.O. Box 416, Sanandaj, Iran (j.abdollahzadeh@uok.ac.ir)

4 Graduated MSc Student, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Kurdistan, P.O. Box 416, Sanandaj, Iran

Abstract

Pythium is a fungus-like genus with worldwide distribution that is found in most terrestrial and aquatic ecosystems. It is a species-rich genus contains important plant pathogenic species. Little is known on the systematics of Pythium in West Azarbaijan province (N.W. Iran). Thus, the aim of this study was to identify 200 isolates collected from different cultivated soils of West Azarbaijan province during 2012–13. Based on morphological and molecular (ITS and coxI sequences) data, 14 Pythium species from six clades, A, D, E, F, I and J, were identified. Of these, P. ornamentatum from clade D, P. nodosum from clade J and P. stipitatum from clade E are new records for Iran mycobiota. Molecular data failed to separate P. glomeratum, P. ornamentatum and P. viniferum from closely related species and they were identified based on morphological features. Detailed description is presented here for P. minus, P. ornamentatumP. nodosum and P. stipitatum.

Keywords


Article Title [Persian]

تاکسونومی مولکولی و ریخت‌شناختی گونه‌های Pythium جدا شده از خاک در آذربایجان ‌غربی

Authors [Persian]

  • فرزانه بدلی 1
  • مسعود ابرین‌بنا 2
  • جعفر عبداله‌زاده 3
  • اسماعیل خالدی 4
1 دانش‌آموخته کارشناسی ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران
2 استادیار گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، صندوق پستی 165، ارومیه، ایران
3 دانشیار گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، صندوق پستی 416، سنندج، ایران (j.abdollahzadeh@uok.ac.ir)
4 دانش‌آموخته کارشناسی ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
Abstract [Persian]

هدف از انجام این تحقیق، شناسایی مولکولی و ریخت ­شناختی تعداد 200 جدایه Pythium جمع‌آوری شده از خاک‌های زراعی و باغی در استان آذربایجان غربی طی سال‌های 91 و 92 بود. براساس داده‌های ریخت‌شناختی و مولکولی (توالی ITS و coxI)، 14 گونه از این جنس متعلق به شش تبار A، D، E، F، I و J شناسایی شدند. از این میان گونه P. ornamentatum از تبار D،P. nodosum از تبار J و P. stipitatum از تبار E برای فلور قارچی ایران جدید هستند. داده‌های مولکولی قادر به تفکیک گونه ­های P. glomeratum، P. ornamentatum و P. viniferum از گونه­ های نزدیک نبود و شناسایی آن‌ها براساس ویژگی‌های ریخت‌شناختی انجام شد. توصیف مفصل برای گونه‌های P. minus، P. ornamentatum، P. nodosum و P. stipitatum نیز ارایه می‌شود.

Keywords [Persian]

  • اُاُمیکوتا
  • ایران
  • کپک آبزی
  • فیلوژنی
  • Pythium
منابع در متن می‌باشد.