@article { author = {Saba, Farkhondeh and Noroozi, Mostafa and Ghahremaninejad, Farrokh and Amoozegar, Mohammad Ali and Sedghi, Mahshid and Shahzadeh Fazeli, Seyed Abolhassan and Papizadeh, Moslem}, title = {Isolation, purification and identification of three diatom species (Bacillariophyceae) from Gomishan wetland (N. Iran) using phylogeny and silica cell wall ultra-structure analysis}, journal = {Rostaniha}, volume = {17}, number = {1}, pages = {28-39}, year = {2016}, publisher = {IRIPP, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, IRAN}, issn = {1608-4306}, eissn = {2423-6608}, doi = {10.22092/botany.2016.107001}, abstract = {Diatoms of Gomishan wetland (Golestan province, N. Iran), one of the most significant habitats in the eastern shore of the Caspian Sea, has been isolated, purified and identified during 2013. Using serial dilution and streaking on F/2 medium, pure, monoalgal and axenic cultures of the isolates were prepared. The isolates were characterized and identified using micro-morphological studies on the prepared permanent slides followed by scanning electron-microscopy. To prove the identification results, the most reliable genomic sequence fragments were investigated using GenBank database. Thus, SSU was amplified and analyzed, phylogenetically. The morphology and sequence data of three isolates were assessed which indicated that, the results of phylogenetic analyses of SSU-based sequences can support the morphological studies data. Finally, the isolates were introduced as Fallacia pygmaea, Halamphora coffeiformis andNavicula veneta.}, keywords = {Algae,Phytoplankton,pure culture,18s rDNA}, title_fa = {جداسازی، خالص‌سازی و شناسایی سه گونه دیاتوم (Bacillariophyceae) از تالاب گمیشان براساس آنالیز فیلوژنی و توصیف فراساختار دیواره سیلیسی}, abstract_fa = {دیاتوم‌های اپیپلیک تالاب گمیشان (استان گلستان)، یکی از زیستگاه‌های با ارزش در حاشیه شرقی دریای خزر، در سال 1392 جداسازی، خالص‌سازی و سپس مورد شناسایی قرار گرفتند. بدین منظور، از روش‌های رقیق‌سازی سریالی و کشت خطی روی محیط کشت f/2 استفاده و کشت خالص تهیه شد. برای شناسایی جدایه‌ها، مطالعات ریزریخت‌شناسی روی لام‌های دایمی تهیه شده انجام گردید و همچنین تصاویر میکروسکوپی الکترونی نگاره مورد بررسی قرار گرفت. به منظور تکمیل روند شناسایی، بهترین توالی برای شناسایی براساس آنالیز توالی‌های موجود در GenBank انتخاب شد و پس از تکثیر قطعه کدکننده ژن SSU، مطالعات فیلوژنتیکی انجام پذیرفت. صفات ریخت‌شناسی و اطلاعات مولکولی سه گونه جدا شده بررسی شد و با تفسیر اطلاعات مشخص شد آنالیزهای فیلوژنتیک توالی SSU تایید کننده نتایج مطالعات ریخت‌شناسی می‌باشد. بر این اساس، آرایه‌های دیاتوم مورد مطالعه متعلق به گونه‌های Fallacia pygmaea، Halamphora coffeiformis و Navicula veneta شناسایی شدند.}, keywords_fa = {باسیلاریوفیسه,جلبک,فیتوپلانکتون,کشت خالص,18s rDNA}, url = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_107001.html}, eprint = {https://rostaniha.areeo.ac.ir/article_107001_7f4952755790c5b33ba754ae25e5d38a.pdf} }